农业生产使用的化肥等原料带来的农业面源污染正在引起人们的重视，这些难题将随着生物农业的发展被逐渐破解。作为合肥战略性新兴产业的重要组成部分，生物农业正在成为重要的经济增长点。
农业面源污染很重要的原因之一就是化肥等农业投入品的增加。有关资料显示，我国化肥(主要是氮肥)的利用效率很低(利用率只有30%～35%)，每年有超过1500万吨的废氮流失到了农田之外，并引发了一系列环保问题。
合肥一家企业研制的化肥养分控失剂能将肥料牢牢固定在土壤中，让土壤按需取肥。“施用在土壤中的化肥经过降雨会流入湖泊、河流，造成生态系统营养化，化肥通过空气挥发进入空气中也会对空气造成污染。”安徽帝元生物科技有限公司总工程师孙文告诉记者，化肥养料控失剂研制的初衷就是为消减因化肥流失而导致的面源污染，无毒无害。控失剂遇水后可以将肥料牢牢固定住，不仅避免了化肥流失带来的污染，同时提高了化肥的使用效率。
生物农业包括生物育种、生物农药、生物化肥、生物饲料等多个领域，是生物产业的重要组成部分。“十二五”以来，合肥生物农业进入了加快发展阶段，已具备生物育种、生物化肥、生物农药等较为完整的产业链，整体实力显着提升。
生物育种方面，丰乐种业是中国种子行业第一家上市公司，被誉为“中国种业第一股”，也是合肥唯一一家入选国家级企业技术中心的农业企业;荃银高科种业是我国首家登陆创业板的种业公司。生物农药领域，福瑞德生物是一家专业从事生物环保型农药制剂，涵盖杀虫剂、除草剂、杀菌剂、卫生类农药的现代化高科技含量的企业;丰乐农化则是全国农药生产百强企业，在新型高效旱地除草剂领域领先全国。
“目前，合肥涌现出丰乐种业、荃银高科、皖垦种业、隆平高科、帝元生物、丰乐农化、福瑞德生物等一批研发能力强、产品技术国内领先、在全国有较高影响力的生物育种、化肥、农药企业，这些企业在各自领域基础较好，发展潜力巨大。”市科技局相关负责人说。
“十二五”期间，合肥将加快生物农业的发展，加快转农作物优良品种选育、生物农药、生物化肥等技术开发，大力发展分子育种、转基因育种与细胞工程、胚胎工程技术在生物育种领域的应用。
