当时，尽管史玉柱已负债2亿多元，可他的兜里还有一张牌，那就是脑白金。巨人危机爆发之后，巨人集团在全国的分公司和营销网络都迅速瓦解。但是巨人在美国的公司还没有受到影响，负责研发的是史玉柱的大学同学袁彬，也就是当初为史玉柱开发脑黄金的人。1997年8月至9月，在美国研发的新产品脑白金进入攻坚阶段，1998年上半年研制成功。直接生产后，马上就可以投放市场。
史玉柱将市场的重点放在了华东，他认为：巨人集团和他史玉柱个人在珠海的信誉已经丧失，要在珠海建立根据地那是不可能的；华东地区本身就是一个大的市场，并且具有很广泛的辐射作用；另外，华东地区人们的生活水平都比较高，因而那里的人们对保健品更容易接受；再者就是因为当年的脑黄金在华东地区的销售不错。
1998年，史玉柱分别在上海和珠海注册了公司。“因为要对全国市场做调研，史总也没有办公室，自己拿了一个小箱子，把它作为移动的办公室。”巨人集团副总裁程晨回忆说。
新公司的思路和产品来源都已经有了，就是缺乏资金。
至于启动资金，2001年，史玉柱在接受媒体采访时说：
离开珠海的时候，真的是一贫如洗。这之前手机已经不用了，交不起话费。直到2010年（2000年），我才重新用上手机。我们的人出差主要是坐火车，坐硬座。工资也非常低，有一段时间，我们的副总经理，月工资也就是几百块钱。这两年如果要回顾的话，主要就是一个字：苦，比1989年刚刚出来创业时还要苦，那个时候苦是苦，（但）没有心理负担。
离开珠海的时候，新公司的思路包括产品来源都已经有了，但是没有钱。
史玉柱从朋友那里借了50万元作为启动资金，把借来的钱作了如下分配：先拿出5万元，给几十个一直跟随着他的工作人员补发了拖欠的工资，稳定军心，鼓舞士气；15万元给了无锡一家公司用于生产脑白金；留出15万元做预备资金；剩下的15万元全部砸向了江苏省江阴县。
启动资金就是这么来的。刚开始我们做得很小，就做江苏一个县。两个月后打开了市场，有了一点利润，就做下一个地方，就是这样一点点滚出来的。到现在，除了广东、北京，内地其他省份都在做了。我们一直是合作生产，到后来我们收购了江苏一个地方负债率很高的药厂，才有了自己的生产线。现在公司的销售额旺季的时候是千万元的量级。
史玉柱每次谈到巨人的复苏，都会提到“江阴调查”。在他看来，“江阴调查”是巨人危机后的一个分水岭，他从那个时候起对巨人的东山再起有了信心。
“脑白金”推出来之后，迅速风靡全国，到2000年，月销售额达到1亿元，利润达到4500万元。史玉柱在全国建立起了拥有200多个销售点的庞大销售网络，规模超过了鼎盛时期的珠海巨人集团。
在脑白金的“滋补”下，巨人奇迹般地活了过来。然而，市场上成功的脑白金还是遭到了舆论的围剿，史玉柱也再次遭受业界非议。不过，这一切并未影响脑白金在市场上的持续走俏。
